随后，美国以防御的名义，加大了对基因武器的研发投入。美国联邦政府在生物防御方面的年度预算从2001年的4.14亿美元增长到了2005年的76亿美元。奥巴马虽然以反布什主义的姿态骗取了公民选票并顺利上台，但是他上台后仍然继续加大了对基因武器的投资。2009，美国公开的生物防御预算高达89.7亿美元。自2001至2009年，美国总共投入570亿美元，呈逐年上升态势——这些都是公开的投入。至于美国秘密生物武器研发经费是多少，则不得而知了。
美国的重要盟友，以色列也是生物武器及基因武器的研发大国。英国《星期日泰晤士报》曾于1998年11月披露：为了报复伊拉克的导弹袭击，以色列军方正在加紧研制一种专门对付阿拉伯人而对犹太人没有危害的基因武器——“种族炸弹”。《星期日泰晤士报》引述以色列军方消息人士称，以色列科学家正尝试识别部分阿拉伯人的独特基因，然后研制一种基因经过改造的细菌或病毒，制造“种族炸弹”。这种致命武器通过在空气及水中传播，可改造被袭目标细胞内的DNA。
“种族炸弹”的研制计划由以色列的生物和化学武器秘密研究中负责，这家中心位于特拉维夫以南20公里的尼斯提兹尤纳。对于媒体的披露，以色列政府非常气愤，并加以否认，和美国一样，他们称这种研究是纯防御性质。美国进行基因战争的计划源远流长。早在1997年春，美国共和党新保守派代表人物、《旗帜周刊》主编威廉·克里斯托尔始建了“美国新世纪计划”，其直接参与的学者还有罗伯特·卡根、布鲁斯·杰克逊等人。“美国新世纪计划”为未来美国的全球战略进行了系统规划。后来小布什政府重要成员如副总统切尼、国防部长拉姆斯菲尔德、国防部第一副部长沃尔福威茨、国家安全会议主席艾布拉姆斯等一直都是该计划的积极支持者。2000年8月克里斯托尔等人以“美国新世纪计划”项目的名义发表了题为《重建美国的国防：面向新世纪的战略、力量和资源》的报告，其中指出：
“目前的国际安全秩序对美国的利益和理想极为有利。未来的挑战就是如何维持和加强这种‘美国式的和平’。如果美国不能维持足够的军事力量，就会失去这个良机”。为此，美军队必须通过“军事领域的革命”完成军队的改革。报告特别提到了基因战争的问题。他们认为，美国武装力量改革势在必行，美国要充分利用其在军事革命领域获得的优势，确保美国在未来非传统战争中的胜利。美国未来可能会同一些敌人在控制空间内进行战争，而同时与另外一些敌人在水下或太空中展开争斗，甚至同个别敌人在自己身体内部(基因方面)进行斗争。
随后，克里斯托尔联合国防部第一副部长沃尔福维茨，向五角大楼提出了基因炸弹的建议。他们认为，基因武器可以歼灭整个种族或者特定人群，让他们神秘消失，政治格局将完全改变。据此报告，基因武器可以消灭某个政党的所有支持者，也可以把一个恐怖王国变成对已有用的政治工具，基因武器将会一劳永逸地改变全世界的政治局势。克里斯托尔领衔的“美国新世纪计划”成员及其支持者，如沃尔福维茨、切尼、拉姆斯菲尔德、艾布拉姆斯等人自1998年后便不断给美国提出重大建议，其中有攻占伊拉克、大量增加国防支出、发展基因武器等。
小布什刚上台不久，美国便先后“遭遇”了“911事件”和“炭疽生物炸弹攻击”， “美国新世纪计划”所提出的三大重点政策，都得以彻底实施。2010年7月2日，美国白宫发布了由奥巴马总统签署的行政命令——“优化控制BSAT行动部署”。这是第二次生物国防计划。BSAT，是“Biological Select Agents and Toxins”的英文缩写，其含义是“特定生物制剂和[生物]毒素”。美国此次大规模行动，仍然是以防御有害生物制剂和毒素的名目，抓紧对基因武器的研发。
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