往后的几年里，拉登与他的信徒们混迹在非洲小国苏丹，用他的财产和资源（沙特王室的保护费）在那儿经营生意，伐木耕地、开山修路。同时，大肆培训和招募他的信徒，开辟新地盘。
直到1996年，苏丹政府在国际舆论（主要是美国）和沙特王室的越来越大的压力下，才将拉登驱逐出境。
在这种情况下，似乎是穷途末路、走投无路的拉登，又重新回到他的根据地（阿富汗），投靠了塔利班政权，试图东山再起，重建他的武装力量和游击队“王国”。
根据西方媒体的“渲染”，世界各地有很多的恐怖事件，都与拉登有着千丝万缕的联系。他也被美国政府指控为直接操纵、资助、策划多起恐怖活动，包括1998年发生在非洲肯尼亚的美国大使馆爆炸事件。
1998年，美国总统克林顿签署了总统特别行政命令，没收了拉登及其随从亲信在美国的资产，并且授权逮捕、暗杀这位已经令美国头痛又后悔的，桀骜不驯的“恐怖分子”领袖。
甚至，克林顿批准了一次用巡航导弹，将他一举击毙的“斩首”行动。但是，幸运的拉登（或许得到美国政府内部“贵人”的关照）却离奇地逃过浩劫，他的19位随从信徒，成为“替死鬼”。
——当然，也非常可能就是策划911的极端分子，已经“选择”了拉登作为911恐怖袭击的“头号”恐怖分子，所以有必要“留下活口”。
