林保华支持“港独”实际上由来已久。上世纪90年代，也就是香港回归前一段时间，港英政府在英国殖民者离开前，采取各种手段给未来的香港挖坑，使香港在回归中国后造成管治上的麻烦，其中忽然开放结社自由、游行示威、言论自由等权利是最典型的标志。当时，颇受英国人青睐的李柱铭成立“香港民主同盟”(民主党的前身)，林保华及其妻杨月清就与李柱铭打得火热，关系颇深，杨月清还曾担任过民主党港岛东区支部副主席。
【上世纪90年代林保华之妻与李柱铭】
林保华在美国期间，除了鼓吹反共反华外，在媒体上竭力为“港独”打气，不遗余力煽动香港政治人物和“港独”分子采取行动。
1999年，林保华在美国安排支持“台独”的反对党“前线”(The Frontier，后前线与民主党合并)召集人刘慧卿与内地出逃人员见面，2003年刘慧卿以民主党立法会议员身份到台湾参加“台独”组织举办的研讨会，林保华以“美国亚洲民主基金会”名义到台湾为刘慧卿打气。
2009年，林保华在台湾成立“台湾青年反共救国团”大会当日，公开力推戴耀廷、黄台仰、罗冠聪、黄之峰等人的“港独”言行，并明确表示要在香港年青人中大力扶植像周竖峰、刘子欣这样敢于在游行闹事中冲在前面的激进分子。
【林保华、杨月清与“港独”分子陈浩天合影图】
