巨浪2被认为采取了分导式多弹头技术，在母舱增加了分离释放机构，可根据需要分别释放母舱中的弹头，攻击一个或多个目标，各弹头落点距离纵向最大差距可达数百千米，横向差距也可以高达上百千米。
因此可以精确打击不同的城市甚至是对手的导弹发射井、军事基地等硬目标。
现在的巨浪3，被认为采取了全导式多弹头技术，不仅具有分导能力，而且每个弹头可自主机动飞行。现在已经全球率先突破的，水漂滑翔高速弹头就是目前最高水平的一种全导式技术。
巨浪3被认为最大可以携带12到14个全导弹头，被全部拦截的概率几乎不存在。多弹头的投送能力还可用于轻、重诱饵的投放。
弹头母舱每次释放子弹头都将子弹头或诱饵置于金属箔条云团之中，最终在弹道上分别形成围绕12个子弹头的，由真、假弹头和金属箔条云团组成的目标群，使导弹防御系统真假难辨。
