中日甲午海战失败后，她又竭力扼杀资产阶级改良派发起的戊戌维新运动。1898年幽禁光绪帝，杀害了谭嗣同等六人。1900年八国联军侵入北京后，与帝逃往西安，下令屠杀义和团，并与八国联军签订了丧权辱国的《辛丑条约》。1906年又宣布预备立宪。1908年11月14日，光绪帝死。她命立醇亲王载沣子、年仅3岁的溥仪为帝，年号宣统。次日，慈禧病死，年七十四，葬于河北遵化定东陵。
1908年11月9日，慈禧太后盖着金黄色柩布的灵柩被缓缓地抬过了北京灰色的土丘，一名名叫亨利·博雷尔的荷兰人目击了慈禧太后葬礼的整个过程。据亨利·博雷尔说，当时清朝外务部的官员们在北京东直门外的一个小土丘上，搭建了一个带顶棚的看台，专门提供给各国公使馆所介绍的在京外国人。下面小编就带大家通过一些珍贵的老照片看看慈禧太后出殡的现场。在东直门内附近，清廷修建了一个单独的亭子，是为各国外交官、尊贵的商业权贵，以及报界记者们所搭建的，为的是可以让他们很方便地观看到。
自1898年到北京，一个叫埃蒙德·巴恪思的英国爵士长期生活在中国，他曾是京师大学堂的教授，英国驻华外交官，1944年死在中国，身后留下一本惊世骇俗的英文回忆录手稿，在尘封68年后，中译本首度在香港出版。
巴恪思在书前誓言记录的绝对是事实。他自述与慈禧太后自1902年开始交往，直到1908年慈禧驾崩前夕他们还有接触。
