这次马来西亚想到的是筹码“新马供水协定”。马哈蒂尔之前曾批评这个协定极不合理，因为新加坡仅仅以0.03令吉（约合0.48元人民币）就能从马来西亚购买1000加仑（约合4.55吨）的生水，在水资源无比宝贵的今天，这个价格是无比荒谬的。在马哈蒂尔的指令下，马来西亚向新加坡提出重新商议水价的要求。
新加坡一再强调，马来西亚在1987年就已经放弃了调整水价的权利，但马哈蒂尔当局却予以否认。马来西亚外长赛夫丁强调：当初协议里所说的“准许签署国在25年后检讨或修改条款”，指的不是仅仅在第25年（也就是2012年）有权提出修订，而是在25年后的任何时间都可以继续讨论。总之就是看马来西亚的心情。
面对马来西亚方面的说法，新加坡表示无法接受，理由就是无论1962年供水协定还是1965年独立条约都已经规定马来西亚不得随意提高水价。而在1987年马来西亚也选择不调整供水价格，而马哈蒂尔在上一次担任首脑时也曾提出涨价，但在2002年放弃了这个主张。
另外，新加坡还以每1000加仑0.5令吉（约合0.8元人民币）的价格向马来西亚出口净化水，实际上新加坡处理每1000加仑生水的成本是2.4令吉（约合3.85元人民币），里外里每1000加仑都补贴马来西亚1.9令吉（约合3.05元人民币）。
