胚胎干细胞研究在美国也一直是一个没有伦理定论的领域，支持者认为这项研究有助于根治很多疑难杂症；反对者却说，进行胚胎干细胞研究就必须破坏胚胎，而胚胎是人尚未成形时在子宫的生命形式。
一篇发表于2014年的论文称，为了收获胚胎干细胞，首先有必要破坏5天的植入前胚胎，但反对者认为，胚胎能发育成人，所以具有显著的道德地位，因此，破坏它是不道德的。
更有甚者，将这个行为称之为杀人。
除了伦理问题，排异反应也是干细胞治疗的风险。
有媒体在采访了医学专家后写道，“给一个没有明显病症的人输入异体细胞，相当于人体有了入侵物，会产生排斥等免疫反应，比如体温升高、白细胞数量增加、炎症反应等。即便是用异体干细胞治疗白血病，也要先抑制患者的免疫系统。”
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在中国，干细胞研究已经开展了几十年。
据称，2009年时，中国的干细胞治疗发展得风生水起，那时有很多美国和欧洲的病患专程来中国进行干细胞治疗，治疗费用很贵，一次七万美金。
