到了1544年，西班牙探险家迪亚哥嘎西亚莫格（Diego GarciaDe Moguer）重新发现了这个美丽的岛屿，就干脆把这个岛用自己的名字来取名。小岛虽然历史上几经易手，但是岛名迪亚哥嘎西亚一直沿用至今，是因为岛名西班牙文就是“感谢主”的意思（Diego Garcia-Deo Gracias感谢上帝）。
好， 长话短说，这个岛的历史不是本文的重点。到了1965年（尽管以前在一次和二次世界大战期间，英国的军事势力一直活跃在印度洋），英国才正式从毛里求斯用区区3百万英镑买下了查戈斯群岛（中国的地产大腕也应该有启发哈哈），当然，包括迪亚哥嘎西亚岛，并且，马上实施清剿计划，赶走了岛上的原住民，并且狼狈为奸，秘密转租给美国政府。
这个小岛被外界鲜为人知，却是是美国在冷战期间建立的绝密军事基地。最初，美国政府的构想仅仅是为了给美国海军的中途补给，但是由于迪亚哥嘎西亚岛的极其重要的地理位置，从1971开始 ，美国海军的工程人员在岛上进行大兴土木，大肆扩建最为先进的通讯设施、使之成为美国全球通讯的中转站之一。
美国海军新建了可以停泊航空母舰和核潜艇、及大型军舰和补给船的深水海港。不仅如此，巨大的地下飞机库及大型的储油库，可以长期存放各种军用飞机，包括B-52、B-2远程轰炸机、SR-71高空远程侦察机等其他军用飞机， 并且可以在此加油载弹，执行军事任务。几乎长达4公里（12，000英呎）的机场双跑道，足够让空客-A330、波音-777等大型飞机起降，并且成为美国航天总署太空飞机飞回地球的降落点之一。
在美国自演自导的911恐怖袭击后，美国以此为借口，悍然发动入侵阿富汗和伊拉克的战争（当然作战计划在911前就已经制定好），这个小岛上的军事基地开始慢慢曝光，并大放异彩，为美国在中东的“反恐”战争立下汗马功劳。美国第一次和第二次海湾战争、及阿富汗战争中，美军B—52，B-2等重型、隐形轰炸机都是从这个基地飞进行空袭任务的。两个环礁深水港，停泊着美国海军的几十艘军舰，载用各类设备和军需物资，以支持重型的坦克、装甲运兵车、海军陆战队所需的弹药、燃料、食物、零部件和药品，甚至， 军舰上还设立有移动的野战医院。
更令人震惊的是，这个秘密的海军基地成为美国秘密关押、筛选、审讯（其中当然包括像水刑、电刑、迷幻剂等许多在美国国内属于违法、不能使用的“技术方法”）中心，以及后来将各类不同背景和作用的“恐怖分子”送往古巴关塔那摩监狱的中转站。
