由于东沙岛海岸为深度1~2米左右的浅礁地形,大型船只无法靠近,必须停靠外海,再以小船接驳上岸,船只靠岸后,须仰赖人力搬运货物上岸,重型机械则赖吊车支援。岛上有海巡署巡防艇码头,可停靠海巡署3艘20吨级海岸巡逻艇。往返的船只有每年3、6、10月各一航次的军用补给舰,主运武器、弹药、汽油,协助海上查缉工作的巡逻快艇,以及20天一航次、载运民生物资的民用商船。
三、太平岛机场(1200m×30m)(台湾省控制)太平岛机场(ICAO代码:RCSP),位于海南省三沙市南沙群岛太平岛上,实际由台湾当局管理,隶属高雄市旗津区。台湾空军每两个月派一架C-130运输机前往。机场有一条长1,200米、宽30米的跑道,其东停机坪可停放两架C-130运输机,占地7,800平方米,西回机坪占地1,800平方米,是目前台湾当局实际操控领土最南端的机场。