导航系统是歼-10A需要升级另外一个项目，歼-10A配备的是国产573型惯导，它属于平台惯导，采用机械陀螺，它优点是成本低，技术成熟，但是它的工作需要高速旋转的机械转子，由于高速转子容易产生质量不平衡、容易受到加速度的影响，而且需要一段预热时间转速才能达到稳定等问题，使用起来很不方便，另外可靠性也比较低，影响飞机的再次出动能力，所以歼-10B/C用新型激光惯导替代了573惯导系统，激光惯导的优点就是精度高，初始对准快捷，可靠性高，因此歼-10A也需要配备新型激光惯导系统。
机载雷达和导航系统的升级，也有助于提高歼-10A配备卫星制导炸弹，从而提高歼-10A的对地攻击能力，从相关图片来看，歼-10A机腹进气道地面较近，难以采用拥有较大翼面的制导炸弹，如激光制导炸弹，相比较之下卫星制导炸弹由原来的普通炸弹改装而来，可以方便的挂载在歼-10A的机腹之下，从而增强飞机的对地攻击能力。
对于超视距空战而言，除了要有先进、完善的探测系统、机载武器之外，电子战系统也必不可少，根据相关资料，歼-10A配备的电子战系统包括雷达告警系统、主动干扰系统、箔条/照明弹投放架，这一套设备在当时已经属于比较完善的系统，但是在新世纪新型导弹不断出现，威胁增大的情况下，仍旧需要进行升级才能适应新世纪战场的环境，首先要增加导弹逼近告警系统，随着机载光电探测系统、红外成像制导空空导弹投入实用，对方可能会逼近发动所谓静默攻击，因此单纯依靠雷达告警系统已经无法提供全方位的警戒，需要导弹逼近告警系统来预警这样的静默威胁，在威胁对抗方向，现代主动雷达制导空空导弹通过一系列技术的采用，具备较强的抗干扰能力，尤其是具备攻击干扰源的能力，这样凭借主动干扰系统也无法对抗它的威胁，所以需要安装拖曳式诱饵来诱离对方主动雷达制导空空导弹，因此歼-10A的机载电子战系统需要增加导弹逼近告警系统、拖曳式诱饵。
