在拉加尔德的力推下，法国势力逐渐扩展到吉布提塔朱拉港（Tadjourah）北岸地区，并同当地部落缔结永久修好条约，将包括吉布提港在内的全部土地割让给法国。1888年的英法协定则以勘界的形式肯定了法国对吉布提全境的占领。同年，由拉加尔德总督建成的吉布提市（Ville de Djibouti）取代塔朱拉，成为总督府所在地。1896年，拉加尔德总督将法占区合并为“法属索马里”（C te fran aise des Somalis）。1946年，“法属索马里”成为法国海外领地。
1958年，法属索马里曾就“加入新独立的索马里”和“留在法国”举行全民公投，结果“留在法国”成为绝大多数人的选择。1967年，法属索马里再次就同一议题举行公投，结果大多数人仍选择留在法国。不久，法属索马里兰更名为“法属阿法尔和伊萨领地”（Territoire fran ais des Afars et des Issas）。1975年12月31日，法属阿法尔和伊萨领地就独立问题举行公投。在多数人选择独立的结果下，吉布提于1977年6月27日正式独立。
不过，独立后的吉布提仍允许法国驻军，对法外交更是其外交的优先方向。两国不仅签署防务协议，还建立了年度例行联合军演机制。政府部门除外交部外，均聘请法国顾问。而2003至2012年法国在吉驻军的租金达到每年3400万美元。此外，法国军队还担负着培训吉布提军队和警察，打击地区极端势力、反海盗和人道主义救援等任务，为吉布提的国家安全提供帮助。
大国军事力量云集的吉布提
地处战略要地的吉布提在冷战后奉行实用主义外交。面对同邻国厄立特里亚的领土争端和90年代邻国索马里解体后的不稳定因素，小国寡民的吉布提对自身安全尤为重视。而大国驻军不仅能为其带来巨额的租金收入和援款，其大量消费还能拉动经济增长。因此，吉布提政府对大国在此驻军是乐观其成的。
