EP-3E上由美国国家安全局操控的作业系统，可以监测中国的加密雷达，语音和电子通讯等等。中国取得EP-3E机后，使用逆向工程，复制机上电脑，解出3000至5000万行的密码电脑程式，等于取得美国海军情报解码路线图的最高机密。中国知道美国如何探测中国的机密，更反过来侦测美国机密，对美军动向一清二楚。
美国海军起初低估中国对EP-3E所做的逆向工程，一直到2008年年底，才惊觉到损失之惨。在奥巴马当选总统后数周，美国国家安全局发现通常监视的系列中国网站上，同时出现大量包括美国海军未来动向等的机密细节，等于向美国展示中国逆向工程的成果。当时研判，中国此举是为给奥巴马新政府一个下马威。
前中央情报局官员指出，当时美军太平洋总司令基亭，为此紧急召开系列会议，并在2009年初报告奥巴马新政府，指出如果中国已对EP -3E的操作系统进行逆向工程的仿制，海军所有相关电脑系统都必须全部换新。结果海军花费数亿元完成更新。
报道指出，中国甚至侦察到美国就伊朗问题举行秘密会议的内容。
