飞机上的机组人员和部分乘客，在飞机转向不久就察觉方向不对，但因驾驶舱关上没办法进入，也无从阻止，部分乘客则是从窗口看见海洋，想起北京至昆明途中为内陆航线，不可能看见海洋而有所警觉，部分乘客则睡到降落中正机场才知道飞机遭劫了。
对于这次机长劫机案，大部分乘客反应都算平静，并不显得慌张。
事件发生后，大陆海协紧急致函台湾海基会，请其转告台湾有关方面：1、保证该机旅客、机组人员及飞机的安全；2、由该机机组人员驾机于下午返回厦门，请台湾有关方面给予必要的协助；3、尽快遣返劫机犯。
台湾方面在下午1点作出人机分离的处理决定，并对其他乘客提供服务和中转第三地飞行的几点决议。
为了了解劫机者的动机及行为，台湾方面迅速将袁斌夫妇带出紧急侦讯，并对相关人员进行侦讯，包括9名机组人员和10名乘客。
侦讯的过程在下午2点30分左右大致结束，2点40分，经过有关方面确认后的正驾驶文飞和副驾驶廖向农在机场地勤人员的陪同下，下机一一检视飞机的轮胎、飞机外观等，作起飞准备。
台湾“中华航空公司”则为飞机加油、为机上旅客提供饮料和食品。18点零3分，这架飞机从中正机场起飞，19点18分在厦门高崎国际机场安全降落，稍作休整后，飞机再度起飞，于当晚23点35分平安飞抵昆明。
本来从北京到昆明只需3个小时左右，但是CA905的旅客们却花了整整16个小时。
