中国对南海的掌控似乎无法阻止。3月9日，中国阻拦了两艘给仁爱礁搁浅军舰上的士兵运送物资的菲律宾运输船，在此搁浅的菲律宾军舰是二战时期的，正在不断老化腐蚀。

菲律宾于1999年把该军舰搁浅在那里并派驻士兵，以宣示“主权”。由于不能通过海上运输对这些士兵进行补给，菲律宾只能通过轻型运输机运送物资。中国称这些运输船除了载有补给物资外，还装有建筑材料以扩大菲律宾在仁爱礁的据点。

目前尚不清楚菲律宾政府是否还能维持在这艘旧军舰上的少量驻军。

新加坡拉惹勒南国际研究院的研究员山姆·贝特曼说，中国海警有能力阻拦菲律宾对其军队的海上补给。他说：“菲律宾无能为力，除了用飞机给岛礁上的少量驻军进行补给。”他说，这两艘菲律宾运输船的出现意味着它们的任务不仅仅是补给物资，“它们可能是要帮助在岛礁上建筑更持久的设施”。他说，如果是这样，这就违背了东盟和中国2002年达成的《南海各方行为宣言》。

北京大学国际关系学院东北亚战略研究中心主任王栋说，自1999年以来，中国政府多次要求菲律宾政府拖走在该区域的船只。他说，菲律宾向岛礁派遣载有建筑材料的船只，意欲“加固其破旧的军舰，以加强在该区域的军事存在”，菲律宾政府应该对最近的这起危机负责。他说，菲律宾政府是有意挑起这场危机，让日本或美国采取行动来“巩固美国的援助承诺”。