1990年10月02日：南方航空一架波音757-200客机，由广州白云机场飞上海。白云机场上空有一架厦门航空波音737-300客机(B-2510)遭劫持，并要求降落，白云机场关闭，停止所有航班升降，静待事件的发展，此时南航当事的B757已上满乘客并在停机坪处等候机场重开跑道。当被劫持的厦门航空B737徐徐降落，厦门航空的B737于跑道滑行时突然转入停机坪位置，并加速试图再起飞，唯此时厦门航空B737右方机翼已撞及等待起飞的南航B757客机油箱，并引发大爆炸，南航B757事后断开两截，厦门航空B737爆炸后解体，同时撞毁了停泊在停机坪的中国西南航空的B707客机(B-2402)，意外造成南航客机上46人死亡，厦门航空客机82人死亡的惨剧。

　　1992年07月31日：中国通用航空公司由南京飞往厦门的GP7552航班2755号雅克-42型飞机起飞滑跑途中冲出跑道，在距机场约600米处失事。107人死亡，19人受伤。

　　1992年11月24日：中国南方航空公司波音737—2523号飞机执行3943航班任务，由广州飞桂林，在广西阳朔县杨堤乡土岭村后山粉碎性解体，141人遇难。这是中国民航史上最严重的一次空难。

　　1993年07月23日：中国西北航空公司BAe146型2716号飞机执行银川至北京航班任务，在银川机场起飞时冲入水塘，55人罹难。

　　1993年10月26日：一架MD82从深圳飞往福州，在福州降落时飞机冲出跑道折为三段，2人死亡。

　　1993年11月26日：一架MD82从沈阳飞乌鲁木齐，在乌鲁木齐附近降落时坠毁，机组4人，旅客8人共12人罹难。