巡防艇指挥官立即要求其他在巡防艇上的队员尾随这艘大陆渔船，并通过无线电指挥船上5名队员务必将船上9人带回台湾。

15日晚上7时半，海巡队特勤队紧急从基隆港出发驰援，谋星舰、新北舰及海军军舰等也抵达彭佳屿东北方40海里处，将大陆渔船团团包围。

7名海巡队员带着瓦斯枪及电棒登上大陆渔船，加上原本在船上的5名队员，以12比9的人数优势，压制住包括船长徐军辉在内的9名大陆渔工。

媒体称，3月16日早上6时，海巡船押着大陆渔工回到基隆。

多数渔工面对媒体采访时一言不发，但有媒体问到“为什么挟持我们的人”时，一名40多岁的渔工惊讶地称“我们没有挟持”。

“海巡署”官员潘进家称，徐军辉情绪不稳，但渔民并未有肢体反抗行为。据悉，徐军辉等人阻挠登检，已依妨害公务罪侦办。