反恐一直是新疆这个多民族聚集地最艰巨的任务之一，民族分裂势力、宗教极端势力、恐怖势力时刻都在试图制造恐怖。
如果那个地方出现了不稳定因素，有少数民族聚集闹事，兵团就会派出自己武装力量，前去镇压。对外宣称是兵团和地方群众发生冲突。分裂分子和西方反华势力明知是怎么回事，但是有苦说不出来。
但对于事态很大的暴乱，需要动用武力的，中央有严格的规定，一定要上报中央，等中央同意后，才能采取军事行动。这样就耽误了时间，贻误了战机。有时候等中央下达命令后，事态已经不可控制了。
在新疆分裂的斗争中，将军王震不得不提。新疆的民族人最怕王震，只要王震一到新疆，分裂势力立马就老老实实，不敢妄动。为什么他们这么怕王震将军呢？原来只要王震将军在新疆，遇到暴乱，王震将军毫不留情，坚决镇压。根本不顾中央的规定。等打完了，杀完了，王震将军才向中央汇报。中央也对他无可奈何。
所以，分裂分子害怕王震将军的刀和枪，害怕到什么程度？新疆民间有一传言，说是夜里小孩哭，大人为了吓唬小孩就说：别哭了，再哭王震就来了。孩子一听，立马就不哭了。可见，王震将军对新疆分裂分子的震慑力是很大的。
后来，中央改变了策略，允许部队遇到暴乱后先行动后汇报。中央这一政策的改变，使地方政府和驻军放开了手脚，对于出现的暴乱能及时进行打击，有力地维护了新疆的安全。随着中央反恐策略的改变，80年代后期，新疆基本上没有出现什么暴乱事件。新疆的形势越来越稳定。分裂分子已没有活动的空间，他们只好偃旗息鼓，等待时机。
