在被问及怎么看习近平提及“两岸政治分歧问题终归要逐步解决，不能一代传一代”时，马英九指出，他的意思可能是希望能够尽快讨论这些政治分歧问题。
答：我在很多场合都提到，我们没有一定要将马习会排除，但必须在“国家有需要”及“人民愿意支持”的情况下进行，才能够真正地解决问题。两岸之间目前进展不慢，但仍有许多问题存在，需要逐步克服。
问：您是否认为明年APEC是马习会最好的时机？
答：大陆国台办发言人已公开排除这个可能性。
问：您认为是否可在任内完成两岸互设办事处之目标？
答：我们当然希望越快越好，两岸互设机构是由海基会及海协会负责，目的纯粹就是服务两岸人民，台方特别强调，互设办事处在政治上很敏感，但性质上应是中性的，然而目前问题在于大陆始终没有同意海基会派驻人员未来可探视在大陆监狱的台湾人。
我觉得这一点蛮令人意外，因为这是人情之常，台湾人在大陆坐牢，我们去探望表示关心，不知为何他们不同意。“国内”两党对这一部分也高度期待，倘若无法做到，两岸互设办事处的协议就很难签成，因为这一部分都无法克服，还谈什么政治协商。
