此后，日本派出军事专家小组，先后访问也门、阿曼、肯尼亚和吉布提讨论建立军事基地的可能性。
日本最终选择吉布提，主要出于以下原因：
第一，吉布提的地理位置优越，正好处于曼德海峡与亚丁湾之间，连接亚洲的阿拉伯半岛和非洲之角，成为海上交通的咽喉；
第二，与也门、肯尼亚和阿曼相比，吉布提国小人稀，面积仅2。3万平方公里，人口不足90万，政策灵活性强，政局相对稳定；
第三，吉布提国内大部分是荒芜的沙漠，适合于军事演练；
第四，尽管吉布提属于阿拉伯国家，也属于伊斯兰国家，但是国内反西方意识较弱，自近代以来一直拥有法国的军事基地（现驻军2900人），美国近年来也在吉布提建立了其在非洲的首个军事基地（现驻军1500人），美、日、法在吉布提保持较好的军事交流关系；
第五，吉布提经济落后，是世界上最贫困的国家之一，西方大国在吉布提的军事基地为当地带来了就业机会，基地租金占该国总收入的20%左右。
2009年3月，日本防卫大臣浜田靖一宣布，日本海上自卫队自14日起将派遣两艘驱逐舰赴索马里海域执行护航任务。执行任务的是来自于日本广岛海军基地的特别警卫队，专门打击海盗。
两个月后，日本又增派两架P-3C巡逻机参与护航任务。2009年索马里海盗猖獗，日本为打击海盗，于当年6月通过了《海盗对策法》，当年公布的《防卫白皮书》也强调海权在日本未来安全战略中的关键作用。
尽管日本在野党反对，但自民党政府最终突破日本和平宪法的束缚，为日本在海外建立军事基地奠定了法律基础。
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